SampleID Prefilter_Reads Unmapped_Reads Percent_Unmapped_Reads Mapped_Singlets Percent_Mapped_Singlets Postfilter_Reads Discarded_Reads Discarded_Percent Percent_Run DV2_10K_S1 569332 1318 0.00231499371192907 660 0.00115925330035902 531378 37954 0.0666640905482214 0.0237113384887568 DV2_10K_S10 931684 2093 0.00224646983311938 1204 0.00129228364982118 928339 3345 0.00359027309688693 0.0388024468825903 DV2_10K_S11 721399 2311 0.00320349764831945 955 0.00132381663961275 718032 3367 0.0046673200267813 0.030044571312434 DV2_10K_S12 31782 210 0.00660751368699264 82 0.00258007677301617 31220 562 0.0176829652004279 0.00132364553520559 DV2_10K_S13 13542 97 0.00716290060552356 33 0.0024368630926008 13406 136 0.0100428297149609 0.000563992443450824 DV2_10K_S14 112249 420 0.00374168144036918 216 0.00192429331218986 111600 649 0.0057817887019038 0.00467490679256473 DV2_10K_S15 427669 917 0.00214418159838567 419 0.000979729650734563 426317 1352 0.00316132335988814 0.0178114077904424 DV2_10K_S16 133970 844 0.00629991789206539 261 0.00194819735761738 132841 1129 0.00842725983429126 0.00557953534552554 DV2_10K_S17 807503 3869 0.00479131346880445 1026 0.00127058351486001 530894 276609 0.342548572574963 0.0336306003591693 DV2_10K_S18 653483 2983 0.00456477062142397 791 0.00121043699683083 530746 122737 0.187819729051865 0.0272160296797796 DV2_10K_S19 296599 1066 0.00359407819985907 544 0.00183412621080988 226016 70583 0.237974504297048 0.0123526506228822 DV2_10K_S23 20512 187 0.00911661466458658 63 0.0030713728549142 16172 4340 0.211583463338534 0.000854276547043517 DV2_10K_S3 509862 1175 0.00230454515143313 585 0.00114736928816033 508061 1801 0.00353232835551581 0.0212345528875147 DV2_10K_S4 615606 2295 0.00372803383982612 1031 0.00167477250059291 1544 614062 0.997491902288152 0.0256385417326088 DV2_10K_S5 479065 1302 0.00271779403629988 522 0.00108962249381608 477221 1844 0.00384916451838477 0.0199519302851698 DV2_10K_S6 724510 2803 0.00386882168638114 1130 0.00155967481470235 720455 4055 0.00559688617134339 0.0301741371440376 DV2_10K_S7 532590 1979 0.00371580390168798 646 0.00121294053587187 529903 2687 0.00504515668713269 0.0221811206215828 DV2_10K_S8 932490 3453 0.00370298877199755 1353 0.00145095389762893 927530 4960 0.00531909189374685 0.0388360148865351 DV2_10K_S9 39389 117 0.00297037243900581 41 0.00104089974358323 39229 160 0.00406204777983701 0.00164045919030309 IPC100fg_S56 185159 91751 0.495525467301076 2437 0.0131616610588737 78216 106943 0.577573868945069 0.00771143677720508 IPC100fg_S58 618640 101615 0.164255463597569 8888 0.0143669985775249 444183 174457 0.282000840553472 0.0257649006953491 IPC100fg_S60 370927 40873 0.110191493204862 2341 0.00631121487516412 301864 69063 0.186190274636249 0.0154482369717829 NTC_S62 23751 22672 0.954570333880679 350 0.0147362216327734 714 23037 0.969938107869142 0.000989173277536592 NTC_S64 259751 248350 0.95610796493565 2432 0.00936281284768875 7691 252060 0.970390874337346 0.0108180181050654 NTC_S66 101858 96920 0.951520744565964 816 0.00801115278132302 4077 97781 0.959973688860963 0.00424214608662044 Serum_S22 9782 9193 0.939787364547127 99 0.010120629728072 486 9296 0.950316908607647 0.000407397288571552 Serum_S26 8030 7539 0.938854296388543 49 0.00610211706102117 442 7588 0.944956413449564 0.000334430610021424 Serum_S30 322168 315455 0.979163045367634 751 0.00233108191999205 5368 316800 0.983337885823546 0.0134175393237088 Serum_S34 476244 433334 0.909899127338087 862 0.00180999655638706 42014 434230 0.911780515870016 0.0198344422713627 Serum_S38 410752 404436 0.984623325023372 642 0.00156298691181053 5644 405108 0.986259348706762 0.0171068545364284 Serum_S42 439506 431121 0.980921762160244 1527 0.00347435529890377 6788 432718 0.984555387184703 0.0183043909947791 Serum_S45 7272 6804 0.935643564356436 46 0.00632563256325633 326 6946 0.955170517051705 0.000302861693160124 Serum_S46 231378 223874 0.967568221697828 1006 0.00434786366897458 6454 224924 0.972106250378169 0.00963634940044047 Serum_S49 5926 5434 0.916976037799528 32 0.00539993250084374 376 5550 0.936550793115086 0.00024680395952515 Serum_S50 241451 234089 0.969509341439878 936 0.00387656294651917 6396 235055 0.973510153198786 0.0100558661544561 Serum_S51 344220 335611 0.974989832084132 2367 0.00687641624542444 6096 338124 0.982290395677183 0.0143359532480167 Serum_S52 593806 574719 0.967856505323287 4091 0.00688945547872538 12587 581219 0.978802841332018 0.0247306230154896 Serum_S53 213634 208891 0.977798477770392 619 0.00289747886572362 4108 209526 0.980770851081757 0.00889735354188254 Serum_S54 182360 177559 0.973672954595306 597 0.00327374424215837 3558 178802 0.98048914235578 0.00759486501164468 Serum_S55 205467 199370 0.97032613509712 858 0.00417585305669524 5181 200286 0.974784271926879 0.00855721720414344 Serum_S57 239622 232506 0.970303227583444 920 0.00383938035739623 6170 233452 0.974251112168332 0.00997969260704278 Serum_S59 312272 304000 0.97351027309525 920 0.00294614951068299 7308 304964 0.976597325408618 0.0130053942033138 Serum_S61 217642 214208 0.984221795425515 370 0.00170003951443196 3040 214602 0.986032107773316 0.00906427731336023 Serum_S63 222470 214723 0.965177327280083 1195 0.00537151076549647 6502 215968 0.970773587449993 0.00926535215584883 Serum_S65 167114 162172 0.970427372931053 700 0.00418875737520495 4230 162884 0.974687937575547 0.00695990497672729 YF_10K_S20 688655 4015 0.00583020525517131 967 0.00140418642135757 577693 110962 0.161128576718386 0.0286808607402619 YF_10K_S21 587976 3408 0.0057961549450998 926 0.00157489421336925 504786 83190 0.141485366749663 0.0244878172301316 YF_10K_S24 161257 664 0.00411765070663599 213 0.00132087289233956 133223 28034 0.173846716731677 0.00671597470488477 YF_10K_S25 761166 4238 0.00556777365252783 1205 0.00158309751092403 638233 122933 0.161506162913215 0.0317007733135202 YF_10K_S27 7214 95 0.0131688383698364 41 0.00568339340171888 6070 1144 0.158580537843083 0.000300446129600816 YF_10K_S28 349868 1380 0.00394434472429602 512 0.00146340905713012 292477 57391 0.164036150776864 0.0145711791615162 YF_10K_S29 239577 1083 0.00452046732365795 365 0.00152351853475083 202223 37354 0.155916469444062 0.00997781846290194 YF_10K_S31 641524 3406 0.00530923239037043 1055 0.00164452148321809 546836 94688 0.147598530998061 0.0267179654624388 YF_10K_S32 97413 670 0.00687793210351801 138 0.00141664870191864 84111 13302 0.136552616180592 0.00405702229315279 YF_10K_S33 787651 4332 0.00549989779737473 1254 0.00159207567818742 678970 108681 0.137981161707406 0.0328038112595248 YF_10K_S35 1127411 6596 0.00585057268378613 1748 0.00155045498048183 946849 180562 0.160156322760732 0.0469540159993603 YF_10K_S36 96901 461 0.0047574328438303 143 0.00147573296457209 82962 13939 0.143847844707485 0.00403569869759476 YF_10K_S37 701010 4970 0.00708977047403033 1075 0.00153350166188785 578992 122018 0.174060284446727 0.0291954174260421 YF_10K_S39 1280746 5208 0.00406638006286961 1746 0.00136326797038601 1058921 221825 0.173199838219288 0.0533400580401617 YF_10K_S40 18747 144 0.00768122899663946 40 0.00213367472128874 16216 2531 0.135008267989545 0.000780768449074922 YF_10K_S41 335946 2206 0.0065665315259 484 0.00144070773279039 285674 50272 0.149643097402559 0.0139913606119872 YF_10K_S43 554844 2424 0.00436879555334472 790 0.00142382363330954 485343 69501 0.125262235871704 0.0231079473707007 YF_10K_S44 2222 1166 0.524752475247525 36 0.0162016201620162 834 1388 0.624662466246625 9.25410729100378e-05 YF_10K_S47 604232 2256 0.00373366521468575 757 0.00125283003879305 509162 95070 0.157340226932701 0.025164841389099 YF_10K_S48 2162 960 0.444033302497687 16 0.00740055504162812 1014 1148 0.530989824236818 9.00422140555813e-05